Eine wesentliche Voraussetzung für eine erfolgreiche Therapie ist eine verlässliche Diagnose. Dabei legt die Naturheilmedizin einen großen Schwerpunkt auf das Suchen nach den Ursachen einer Erkrankung. Die verschiedenen Richtungen der Naturheilmedizin bedienen sich eines umfangreichen Katalogs von Diagnoseverfahren. Selten stehen diese Verfahren allein. In den häufigsten Fällen werden sie in Kombination verwendet und vervollständigt das Bild, das der Therapeut von seinem Patienten gewinnt. Je umfassender untersucht wird, desto sicherer ist der Befund. Nie werden von einem Therapeuten alle Diagnoseformen angewendet und beherrscht.
Von den zahlreichen Reflexzonen des menschlichen Organismus sind wohl die Hand- und Fußreflexzonen am bekanntesten, wie sie auch medizinisch zu diagnostischen wie therapeutischen Zwecken am meisten genutzt werden. Wissenschaftlich anerkannt sind die Headschen Zonen: Neurophysiologisch wurde nachgewiesen, dass über die Haut auf innere Organe eingewirkt werden kann. Die Beschaffenheit und Stellung der Finger und Zehen ermöglicht zugleich auch wichtige Aussagen über angeborene organische Schwachbereiche und seelisch-geistige Qualitäten der betreffenden Person. Relativ neu sind die detaillierten Erkenntnisse der Abbildung des menschlichen Organismus im Bereich der Schienbeine. Ebenso spiegelt sich der Organismus am Schädel, am Gaumen und am After wider.
